Goodnotes には、ブラウザからURLを受け取ってそのページをPDF化して取り込むという便利な機能があります。
しかしコレが動かないことがありますので、その対策です。
１．ChromeやSafari、Goodnotesが最新のものであるか確認します。
もしAppStoreでアップデートが来ていたらそれらを適用してみてください。
２．アップデートしたアプリを念の為一度起動させておいてください。
３．端末の電源を長押しして再起動を行います。おそらく上記手順で解決したとしても、再起動をかけないと共有情報が更新されないと思います。
４．再起動後、ブラウザを起動してください。
５．画面上部の共有ボタン
を押します。
を押します。
６．（表示されない場合は）表示されない原因の１つとして、そのWebページの読み込みが終わってない場合があります。完全に読み込みが完了してから再度、共有ボタンを押下してみてください。
を押下してみてください。
ポイント
・各アプリの更新
・再起動
・読み込みが終わるまで待つ
参考
教えてください。
「goodnoteで開く」が出てこないのですが、何か設定が必要なのでしょうか？
safariもgoodnoteもアップデート済みで再起動もしています。
今まで出てきていたのであれば、一時的にデータがおかしくなっているだけだと思います。
今お使いのアプリ以外をつかって、共有から、Goodnotesで開くが出てくるか確かめてみてはいかがでしょうか。
Chromeを使ったりするのもいいですし、印刷menueからPDFに印刷して、そこからGoodnotesに共有するのもありだと思います。
システム上、共有できるアプリケーションをSafariが順番にサーチしているはずなのですがこのサーチが止まっている可能性上がります。
不要なアプリが多すぎる場合は消してみたりするのもいいと思いますし、面倒ですがGoodnotes5を一度アンインストールするのも手かと思います。
（その場合は、ノートのバックアップは必ず取っておいてください。）
Safariの再インストールもいいかもしれません。
おすすめは、一旦Chromeから、Goodnotesで開く を試すことですので、一度お試しになってみてください。