言語ごとに、TAB派、スペース派と分かれるんですね。TAB一強かとおもってました。
1. エディタ設定でタブをスペースに変える設定が効いている可能性がある。
メニューの
[Windows][General][Editor][Text Editors][Insert Space for tabs]のチェックがONになってるとタブの代わりにスペースが入る。
2. その言語のフォーマッターが効いている可能性がある。
メニューの
[Windows][Preferences][PHP][Code Style][Formatter][ActiveProfile]が
PSR-2になっているとタブが効かない。PHP Conventions にすればタブが入力できるようになる。